四川柑橘根系的主要作用是将树体固定不动在土壤层中，消化吸收水份，矿物；代谢柠檬酸，使土壤层中难溶解水的化学物质变为可溶强电解质的化学物质，有利于根系消化吸收；生成生长激素；存储营养元素；繁育新主茎。柑橘根系主要遍布在距土层10~50公分的土壤层中，约占总根量的80%之上，特别是在树干渗水周边的土壤层中遍布更为聚集。

丛枝菌根是土壤层中的丛枝菌根细菌与柑橘根系产生的共生体，其相互依存主要表现在绿色植物为丛枝菌根提供生长发育所需糖分，相反丛枝菌根协助绿色植物消化吸收水份和营养物质。因为有丛枝菌根的帮助，柑橘根系吸收力大大的提高，非常是提升了对磷的使用率.在我国红土壤层由于磷被固定不动,柑橘园呈广泛缺磷的状况,假如打疫苗菌根细菌,可明显提升柑橘对磷钾肥的使用率。

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